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pA-Tn5 转座酶

  • 表达系统: E. coli
  • Accession #: Q46731
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基本描述

产品名称 pA-Tn5 转座酶
别名 EnzymoPure™ pA-Tn5 转座酶
规格或纯度 EnzymoPure™, 无动物源, 无载体, 无菌, ≥95%(SDS-PAGE), 40μM
产品介绍

本公司生产的 pA-Tn5 Transposase ,中文名为 pA-Tn5 转座酶,是一种来源于 E.coli,经过改造的具有极高活性 Tn5 转座酶突变体和 Protein A 的融合蛋白。pA-Tn5 转座酶在和适当测序接头(Adapters)组装后成为 pA-Tn5 Transposome (pA-Tn5 转座体),可用于 CUT&Tag 实验。CUT&Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation),即靶向剪切及标记,是一种新兴的蛋白质与 DNA 相互作用的研究方法,具有特异性强、背景噪音较低、灵敏度高、重复性较好、成本低等优点,被用来替代传统的 ChIP-Seq (Chromatin Immunoprecipitation-sequencing)方法。CUT&Tag 技术的核心是利用 pA/G-Tn5 Transposome 上的 Protein A 或 Protein G 具有与靶蛋白上结合的抗体特异性结合的能力,使 Tn5 转座体能通过 Protein A/G 及抗体与靶蛋白形成复合物,随后加入 Mg2+激活 Tn5 转座体的酶活性对靶蛋白结合的 DNA 进行切割实现靶向的 DNA 片段化(DNA Fragmentation),同时将其携带的测序接头连接到片段两端从而实现标记,后续通过 PCR 反应进行缺口填补,并借助双端标记 PCR 引物 (Dual-indexed PCR primers)扩增后,制备成适用于二代测序(Next generation sequencing, NGS)平台的 DNA 文库 。 

活性定义:超活性突变,高效快速反应

组分和说明 

P745696Component800pmol5*800pmolStorage
P745696pA-Tn5 Transposase (40μM) 20μl5*20μl-20℃. Avoid freeze/thaw cycle.

产品应用 

pA-Tn5 转座酶在和适当测序接头(Adapters)组装后成为 pA-Tn5 Transposome (pA-Tn5 转座体),可用于 CUT&Tag 实验。 

产品优势 

与野生型 Tn5 转座酶相比,插入效率至少提升 1000 倍,具有转座随机性好、稳定性高、插入位点易测序等特点。

使用说明 

构建 CUT&Tag 实验所需的 pA-Tn5 转座体。 

1.ME 和接头(Adapters)的序列。 

ME: 5'-[phos]CTGTCTCTTATACACATCT-3' 

Primer 1: 5'-TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-3' 

Primer 2: 5'-GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG-3' 

注:本接头序列参考 DNA Sample Preparation Kit,也可按照不同高通量测序的要求进行设计。 

2.制备 Adapter 1 和 Adapter 2。 

按照下表分别配制 Adapter 1 和 Adapter 2 退火反应体系。退火反应后 Adapter 1 或 Adapter 2 的终浓度为 200μM。  

Component Volume
Annealing Buffer for DNA Oligos (5X) 10μl
ME (500μM) 20μl
Primer-1 or 2 (500μM) 20μl
Total Reaction Volume 50μl

使用 PCR 仪按下表设置退火反应程序,反应结束即可获得 Adapter 1 和 Adapter 2。 

Step Temperature
195℃, 2min
295℃, 8s, -0.1℃ per cycle
3GOTO step 2700 cycles
44℃ forever

3.pA-Tn5 转座体的制备。 

按照下表,将 pA-Tn5 Transposase、Adapter 1 和 Adapter 2 按摩尔比 1:0.5:0.5 混合,吹打混匀,室温孵育 1 小时。

Component Volume
pA-Tn5 Transposase (40μM) 10μl
Adaptor 1 (200μM) 1μl
Adaptor 2 (200μM) 1μl

注意事项: 

(1)本产品含 50%甘油,-20℃保存不会冻结。须避免-80℃保存,否则会冻结, 反复冻融可能会降低本产品的酶活性。 

(2)本产品较为粘稠,吸取时注意取样量准确,加样后请注意充分吹打混匀,避免产生气泡。 

(3)本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。 

(4)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。



表达系统 E. coli
种属 大肠杆菌(E.coli)
无载体 Yes
无动物源 Yes
Accession # Q46731
来源 重组表达

储存与运输

物理形态 液体
储存缓冲液 50mM HEPES, 100mM NaCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 0.1% Triton X-100, 50% (v/v) Glycerol, pH7.2
浓度 40μM
储存温度 -20°C储存,避免反复冻融
运输条件 超低温冰袋运输
稳定性与储存 长期储存-20℃(24个月);避免反复冻融。
分子类型

质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)

C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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