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简介:“适用于质谱分析” (又名:质谱级)

         “适用于质谱分析”(中文也称为MS级质谱级)是指符合质谱(MS)应用严格纯度和性能标准的试剂,尤其是酶和化学品。这些试剂经过优化,可确保最低的背景噪音高消解效率,并与下游LC-MS/MS工作流程兼容


主要特点

1. 高纯度、低污染物

         · 不含角蛋白自溶碎片核酸酶蛋白酶或其他干扰物质。

         · 在 MS 分析中产生信号抑制或非特异性信号的试剂。

2. 持续表现

         · 已验证可重复的酶活性和裂解特异性。

         · 批次间的一致性对于定量蛋白质组学测序至关重要

3. 稳定性和配方

         · 稳定的冻干形式不含甘油的液体形式提供,以兼容LC-MS 工作流程

         · 配方中不含干扰 MS 检测的添加剂(例如 Tris、EDTA、甘油)。


常见的 MS 级蛋白酶

切割特异性

应用

胰蛋白酶(MS级)

在 K 或 R 之后(除非后面跟着 P)

自下而上的蛋白质组学标准

Lys-C(赖氨酸蛋白酶)

仅限 K 之后

适用于完整或部分消化

Glu-C(谷氨酸蛋白酶)

在 E 之后(有时是 D)

抗体测序、PTM图谱

天冬氨酸-N

在D之前

N端测序

糜蛋白酶

芳香族残基 (F, W, Y) 之后

与胰蛋白酶互补,实现全面覆盖

         在谈到这些酶在质谱工作流程中的应用时,中文通常将这些酶统称为“质谱级蛋白酶”。


典型应用

1.蛋白质组学

          · 蛋白质表达、修饰和相互作用的全面分析。

          · 无标记或基于标记的定量(例如,TMT、 iTRAQ )。

2. 蛋白质和抗体测序

         · 从头测序或数据库驱动测序的肽的高分辨率映射。

         · 单克隆抗体( mAb )的碎片图谱。

3. 生物制药表征

         · 生物仿制药治疗性抗体ADC 结合位点的分析。

         · 翻译后修饰(PTM)分析(例如糖基化、磷酸化)。

4. 生物标志物的发现

         · 在临床或研究环境中检测低丰度生物标志物。


Summary Table (中文对照)

项目

内容

中文名称

质谱级(适用于质谱分析)

英文名称

Suitable for Mass Spectrometry / MS-Grade

特点

高纯度、低背景、消除抑制物、批次一致性

常用酶

Trypsin(胰蛋白酶)Lys-C(赖氨酰胰蛋白酶)Glu-C(谷氨酰胰蛋白酶)

适用领域

蛋白质组学、抗体序列分析、PTM分析、生物药表征


Selection Tips

         · 检查供应商认证:查找“MS 级”、“质谱验证”或“测序级”等术语。

         · 检查消化性能:在扩大规模之前用已知蛋白质验证酶的效率。

         · 避免使用稳定剂,除非其明显与 MS 兼容。


含酶消化和净化的 LC-MS 样品工作流程

         这是一个实用的分步协议,用于使用MS 级蛋白酶(如胰蛋白酶、Lys-C 或 Glu-C)制备用于LC-MS/MS 分析的蛋白质。


1. 样品制备

步骤

描述

A. 变性

使用 6–8 M 尿素或 2–4% SDS 展开蛋白质。

B. 还原

添加 5–10 mM DTTTCEP,在 37°C 下孵育 30–60 分钟以破坏二硫键。

C. 烷基化

添加 10–20 mM IAA 或 CAA,在室温下黑暗中孵育 20–30 分钟以防止重新形成。

D. 缓冲液更换

消化前稀释或脱盐以将变性剂浓度降低至 <1 M。


2. 酶消化

范围

典型设置

胰蛋白酶Lys-CGlu-C(MS级、测序级)

酶:蛋白质比例

1:20 至 1:100(重量/重量)

缓冲

50 mM 碳酸氢铵Tris-HCl(MS 兼容)

时间/温度

37°C,持续4-16小时

选修的

双重消化:例如,Lys-C(2小时),然后胰蛋白酶消化过夜


3. 肽清理

          在 LC-MS 之前去除盐、去垢剂或抑制剂:

方法选项

         · C18 反相 SPE(固相萃取) – 例如 Sep-Pak 或 OMIX 吸头

         · StageTips – 家用 C18 吸头,适用于小样本

         · 磁珠净化——例如 SP3 方法(顺磁珠)

         确保最终洗脱是在与 LC-MS 兼容的溶剂中进行的(例如,水或 ACN 中的 0.1% FA)。


4. LC-MS/MS 分析

成分

设置

LC

配备反相 C18 色谱柱的NanoLC (例如,75 μm × 15 cm)

坡度

5%–35% ACN 60–120 分钟

多发性硬化症

Orbitrap、TOF 或 Q- Exactive平台

扫描模式

DDA(数据相关采集)或DIA(数据独立采集)

输出

用于数据库搜索或从头分析的.RAW或.mzML文件


附:中文双语宣传册样式资料:质谱级蛋白酶样本前处理工作流程


适用于蛋白质组学、抗体序列分析、PTM研究等领域


样本处理流程(Sample Workflow)

步骤

英文

中文

1

Denature

蛋白变性(使用尿素SDS

2

Reduce

还原二硫键(加入DTTTCEP

3

Alkylate

烷基化(加入IAA防止二硫键复原)

4

Buffer Exchange

缓冲液更换,降低变性剂浓度以适应消化


酶解步骤(Enzymatic Digestion)

         · 使用质谱级酶(Trypsin、Lys-C、Glu-C)

         · 建议比例:酶:蛋白 = 1:50(可根据需求调整)

         · 温度:37°C

         · 时间:4–16 小时(可选择多酶联合消化)



肽段纯化(Peptide Cleanup) 

方法

英文

中文

C18 SPE

Solid-Phase Extraction

固相萃取柱去除盐和杂质

StageTips

Mini C18 Column

微量C18柱适用于小样本

SP3

Magnetic Bead Cleanup

磁珠法清洁处理,适合自动化平台


LC-MS/MS 分析建议(LC-MS/MS Setup)

组件

建议设置

LC系统

纳升级反相C18柱(75μm × 15cm)

流动相梯度

60分钟内5%-35%乙腈梯度

MS平台

Orbitrap、TOF、Q-Exactive等

模式

数据依赖采集(DDA)或数据独立采集(DIA)


适用范围

         · 蛋白质组学研究(Proteomics)

         · 抗体序列测定(Antibody Sequencing)

         · 后翻译修饰检测(PTMs: 磷酸化、糖基化等)

         · 生物制药质量控制(mAb、ADC等)


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